Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHD1Q9BUP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EFHD1Q9BUP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHD1Q9BUP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHD1Q9BUP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD1Q9BUP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms