Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF479Q96JC4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF479Q96JC4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF479Q96JC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF479Q96JC4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms