Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIB2Q96AX9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIB2Q96AX9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MIB2Q96AX9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIB2Q96AX9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIB2Q96AX9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MIB2Q96AX9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms