Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCLNQ969V3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLNQ969V3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLNQ969V3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLNQ969V3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCLNQ969V3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms