Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKD2Q969F2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NKD2Q969F2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NKD2Q969F2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKD2Q969F2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKD2Q969F2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NKD2Q969F2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NKD2Q969F2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKD2Q969F2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKD2Q969F2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms