Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSMEM1Q8WWF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSMEM1Q8WWF3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSMEM1Q8WWF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms