Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU79

SMAP2, Stromal membrane-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP2Q8WU79 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAP2Q8WU79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAP2Q8WU79 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAP2Q8WU79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAP2Q8WU79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAP2Q8WU79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAP2Q8WU79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms