Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPRQ8TBG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNPRQ8TBG9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPRQ8TBG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPRQ8TBG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPRQ8TBG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNPRQ8TBG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPRQ8TBG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms