Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POMGNT2Q8NAT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMGNT2Q8NAT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMGNT2Q8NAT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMGNT2Q8NAT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms