Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIML2Q8N7C3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIML2Q8N7C3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML2Q8N7C3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIML2Q8N7C3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIML2Q8N7C3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML2Q8N7C3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIML2Q8N7C3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms