Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY0

SLC16A13, Monocarboxylate transporter 13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A13Q7RTY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A13Q7RTY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC16A13Q7RTY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A13Q7RTY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A13Q7RTY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC16A13Q7RTY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A13Q7RTY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms