Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP26C1Q6V0L0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP26C1Q6V0L0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP26C1Q6V0L0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP26C1Q6V0L0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP26C1Q6V0L0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP26C1Q6V0L0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP26C1Q6V0L0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP26C1Q6V0L0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP26C1Q6V0L0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP26C1Q6V0L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP26C1Q6V0L0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms