Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms