Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRGCQ6NXR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRGCQ6NXR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRGCQ6NXR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGCQ6NXR0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRGCQ6NXR0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRGCQ6NXR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms