Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SPATA1Q5VX52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SPATA1Q5VX52 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPATA1Q5VX52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPATA1Q5VX52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPATA1Q5VX52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPATA1Q5VX52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms