Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD4Q5VWC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD4Q5VWC8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD4Q5VWC8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD4Q5VWC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD4Q5VWC8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms