Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BROXQ5VW32 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BROXQ5VW32 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BROXQ5VW32 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BROXQ5VW32 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BROXQ5VW32 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms