Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIN9Q5TKA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LIN9Q5TKA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIN9Q5TKA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LIN9Q5TKA1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN9Q5TKA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LIN9Q5TKA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms