Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2LQ5T4T6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2LQ5T4T6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2LQ5T4T6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2LQ5T4T6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2LQ5T4T6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP2LQ5T4T6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms