Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMTC4Q5T4D3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMTC4Q5T4D3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMTC4Q5T4D3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMTC4Q5T4D3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms