Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLRC3Q5JS37 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NHLRC3Q5JS37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC3Q5JS37 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NHLRC3Q5JS37 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLRC3Q5JS37 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms