Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB2Q5IJ48 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB2Q5IJ48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB2Q5IJ48 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRB2Q5IJ48 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRB2Q5IJ48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms