Protein–RNA interactions for Protein: Q504T8

MIDN, Midnolin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIDNQ504T8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIDNQ504T8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIDNQ504T8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIDNQ504T8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIDNQ504T8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIDNQ504T8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIDNQ504T8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIDNQ504T8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms