Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKIDA1Q1XH10 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIDA1Q1XH10 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SKIDA1Q1XH10 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKIDA1Q1XH10 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIDA1Q1XH10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKIDA1Q1XH10 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms