Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPROQ16827 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPROQ16827 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPROQ16827 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPROQ16827 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPROQ16827 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPROQ16827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPROQ16827 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPROQ16827 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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