Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD1Q15797 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD1Q15797 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD1Q15797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD1Q15797 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD1Q15797 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD1Q15797 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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