Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGN3Q15651 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGN3Q15651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGN3Q15651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGN3Q15651 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGN3Q15651 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGN3Q15651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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