Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRR1Q13601 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRR1Q13601 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRR1Q13601 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRR1Q13601 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRR1Q13601 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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