Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3BQ13214 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3BQ13214 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3BQ13214 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3BQ13214 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3BQ13214 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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