Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL28Q13084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL28Q13084 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL28Q13084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL28Q13084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL28Q13084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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