Protein–RNA interactions for Protein: Q12968

NFATC3, Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFATC3Q12968 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFATC3Q12968 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NFATC3Q12968 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFATC3Q12968 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NFATC3Q12968 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFATC3Q12968 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFATC3Q12968 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFATC3Q12968 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms