Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCBP1Q09161 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCBP1Q09161 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCBP1Q09161 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP1Q09161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCBP1Q09161 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP1Q09161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP1Q09161 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms