Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.079e-11■■■■■ 30.7
SRSF1Q07955 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-209ENST00000592167 461 ntTSL 411.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-205ENST00000590432 554 ntTSL 410.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-214ENST00000614600 2285 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-220ENST00000621668 2055 ntTSL 58.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-206ENST00000590538 568 ntTSL 48□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-208ENST00000591610 559 ntTSL 47.97□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-212ENST00000612035 2161 ntTSL 57.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-216ENST00000616784 2542 ntTSL 56.82□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-202ENST00000588093 334 ntTSL 36.62□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-204ENST00000589774 552 ntTSL 45.35□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-210ENST00000593014 577 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 AP2B1-219ENST00000620039 3428 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 30.5
SRSF1Q07955 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 313.48□□□□□ -0.256e-11■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 MARS-219ENST00000549603 402 ntTSL 310.31□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-206ENST00000493894 999 ntTSL 222.7■■□□□ 1.226e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-203ENST00000413137 1555 ntTSL 522.63■■□□□ 1.216e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-205ENST00000488106 640 ntTSL 521.95■■□□□ 1.16e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-204ENST00000414672 900 ntTSL 521.52■■□□□ 1.046e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-202ENST00000406335 755 ntTSL 221.12■□□□□ 0.976e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.456e-10■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-9■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.951e-9■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 GOT1-202ENST00000471741 716 ntTSL 210.44□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 30.4
SRSF1Q07955 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-26■■■■■ 30.3
SRSF1Q07955 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-26■■■■■ 30.3
SRSF1Q07955 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 56.77□□□□□ -1.332e-26■■■■■ 30.3
SRSF1Q07955 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 AGXT-203ENST00000472436 1034 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 AGXT-204ENST00000476698 507 ntTSL 513□□□□□ -0.333e-10■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 519.6■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 POLR3GL-204ENST00000622508 1600 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 30.2
SRSF1Q07955 AKAP8-205ENST00000599883 860 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 SRSF11-205ENST00000460795 528 ntTSL 24.5□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 SRSF11-206ENST00000461935 3501 ntTSL 1 (best)4.04□□□□□ -1.761e-9■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 SRSF11-216ENST00000489188 784 ntTSL 24□□□□□ -1.771e-9■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 215.47■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 29.9
SRSF1Q07955 SYTL1-207ENST00000496001 876 ntTSL 519.84■□□□□ 0.775e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.295e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.245e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-206ENST00000490170 2681 ntTSL 216.12■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.065e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 SYTL1-204ENST00000483926 2525 ntTSL 213.92□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 TCEA1-209ENST00000521836 625 ntTSL 423.36■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 HERPUD1-216ENST00000568814 509 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 HERPUD1-211ENST00000566550 511 ntTSL 22.9□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 29.8
SRSF1Q07955 USP39-209ENST00000458268 751 ntTSL 417.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-218ENST00000493829 1660 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-208ENST00000455732 623 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-211ENST00000465282 568 ntTSL 415.23■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-205ENST00000442708 561 ntTSL 414.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-206ENST00000448971 610 ntTSL 314.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-217ENST00000491659 648 ntTSL 314.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 29.34□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 USP39-214ENST00000474572 293 ntTSL 47.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 37.23□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 29.6
SRSF1Q07955 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 211.01□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 29.4
SRSF1Q07955 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.473e-27■■■■■ 29.3
SRSF1Q07955 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 29.3
SRSF1Q07955 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 29.3
SRSF1Q07955 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 29.3
SRSF1Q07955 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 583 ntTSL 216.38■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-208ENST00000498199 511 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-213ENST00000520629 415 ntTSL 315.72■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-220ENST00000524210 2591 ntTSL 513.75□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 401.8 ms