RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413137.6

RHBDD3-203, Transcript of rhomboid domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene RHBDD3, Length 1,555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3-203ENST00000413137 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.01■■■■■ 7.36
RHBDD3-203ENST00000413137 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.58■■■■■ 6.17
RHBDD3-203ENST00000413137 ABCC9O60706 1549 aa51.67■■■■■ 5.86
RHBDD3-203ENST00000413137 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.04■■■■■ 5.76
RHBDD3-203ENST00000413137 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.73■■■■■ 5.71
RHBDD3-203ENST00000413137 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.4■■■■■ 5.66
RHBDD3-203ENST00000413137 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.19■■■■■ 5.62
RHBDD3-203ENST00000413137 NACADO15069 1562 aa50.18■■■■■ 5.62
RHBDD3-203ENST00000413137 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.98■■■■■ 5.59
RHBDD3-203ENST00000413137 SCRIBQ14160 1630 aa49.2■■■■■ 5.47
RHBDD3-203ENST00000413137 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.1■■■■■ 5.45
RHBDD3-203ENST00000413137 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.92■■■■■ 5.42
RHBDD3-203ENST00000413137 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.58■■■■■ 5.37
RHBDD3-203ENST00000413137 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
RHBDD3-203ENST00000413137 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.54■■■■■ 5.2
RHBDD3-203ENST00000413137 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
RHBDD3-203ENST00000413137 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
RHBDD3-203ENST00000413137 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.12■■■■■ 5.13
RHBDD3-203ENST00000413137 SMARCA4P51532 1647 aa47.08■■■■■ 5.13
RHBDD3-203ENST00000413137 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.97■■■■■ 5.11
RHBDD3-203ENST00000413137 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
RHBDD3-203ENST00000413137 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.71■■■■■ 5.07
RHBDD3-203ENST00000413137 WIZO95785 1651 aa46.65■■■■■ 5.06
RHBDD3-203ENST00000413137 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.6■■■■■ 5.05
RHBDD3-203ENST00000413137 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.6■■■■■ 5.05
RHBDD3-203ENST00000413137 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.55■■■■■ 5.04
RHBDD3-203ENST00000413137 SMARCA2P51531 1590 aa46.48■■■■■ 5.03
RHBDD3-203ENST00000413137 NCAPD3P42695 1498 aa46.37■■■■■ 5.01
RHBDD3-203ENST00000413137 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
RHBDD3-203ENST00000413137 HMGXB3Q12766 1538 aa46.17■■■■■ 4.98
RHBDD3-203ENST00000413137 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
RHBDD3-203ENST00000413137 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.69■■■■■ 4.9
RHBDD3-203ENST00000413137 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.11■■■■■ 4.81
RHBDD3-203ENST00000413137 NESP48681 1621 aa45.08■■■■■ 4.81
RHBDD3-203ENST00000413137 CFTRP13569 1480 aa45.06■■■■■ 4.8
RHBDD3-203ENST00000413137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.9■■■■■ 4.78
RHBDD3-203ENST00000413137 PRDM2Q13029 1718 aa44.63■■■■■ 4.74
RHBDD3-203ENST00000413137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.6■■■■■ 4.73
RHBDD3-203ENST00000413137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.6■■■■■ 4.73
RHBDD3-203ENST00000413137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.43■■■■■ 4.7
RHBDD3-203ENST00000413137 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.39■■■■■ 4.7
RHBDD3-203ENST00000413137 ABCC8Q09428 1581 aa44.39■■■■■ 4.7
RHBDD3-203ENST00000413137 ERCC6Q03468 1493 aa44.36■■■■■ 4.69
RHBDD3-203ENST00000413137 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.22■■■■■ 4.67
RHBDD3-203ENST00000413137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.67
RHBDD3-203ENST00000413137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
RHBDD3-203ENST00000413137 CUX1P39880 1505 aa44.11■■■■■ 4.65
RHBDD3-203ENST00000413137 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.11■■■■■ 4.65
RHBDD3-203ENST00000413137 SYNJ1O43426 1573 aa44.08■■■■■ 4.65
RHBDD3-203ENST00000413137 TOPBP1Q92547 1522 aa44.01■■■■■ 4.64
RHBDD3-203ENST00000413137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
RHBDD3-203ENST00000413137 TRIM41Q8WV44 630 aa43.98■■■■■ 4.63
RHBDD3-203ENST00000413137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.98■■■■■ 4.63
RHBDD3-203ENST00000413137 TOP2BQ02880 1626 aa43.94■■■■■ 4.62
RHBDD3-203ENST00000413137 WDR62O43379 1518 aa43.91■■■■■ 4.62
RHBDD3-203ENST00000413137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.89■■■■■ 4.62
RHBDD3-203ENST00000413137 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
RHBDD3-203ENST00000413137 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
RHBDD3-203ENST00000413137 CUX2O14529 1486 aa43.61■■■■■ 4.57
RHBDD3-203ENST00000413137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.61■■■■■ 4.57
RHBDD3-203ENST00000413137 SOGA1O94964 1423 aa43.57■■■■■ 4.57
RHBDD3-203ENST00000413137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
RHBDD3-203ENST00000413137 IFT140Q96RY7 1462 aa43.4■■■■■ 4.54
RHBDD3-203ENST00000413137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.36■■■■■ 4.53
RHBDD3-203ENST00000413137 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.3■■■■■ 4.52
RHBDD3-203ENST00000413137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
RHBDD3-203ENST00000413137 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
RHBDD3-203ENST00000413137 WDR97A6NE52 1622 aa43.27■■■■■ 4.52
RHBDD3-203ENST00000413137 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
RHBDD3-203ENST00000413137 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.51e-7■■■■■ 37.9
RHBDD3-203ENST00000413137 KIF27Q86VH2 1401 aa43.15■■■■■ 4.5
RHBDD3-203ENST00000413137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.07■■■■■ 4.49
RHBDD3-203ENST00000413137 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.06■■■■■ 4.48
RHBDD3-203ENST00000413137 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
RHBDD3-203ENST00000413137 EEA1Q15075 1411 aa42.97■■■■■ 4.47
RHBDD3-203ENST00000413137 IGF1RP08069 1367 aa42.95■■■■■ 4.47
RHBDD3-203ENST00000413137 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.93■■■■■ 4.46
RHBDD3-203ENST00000413137 GRIN2BQ13224 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
RHBDD3-203ENST00000413137 PBRM1Q86U86 1689 aa42.82■■■■■ 4.45
RHBDD3-203ENST00000413137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
RHBDD3-203ENST00000413137 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.72■■■■■ 4.43
RHBDD3-203ENST00000413137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.68■■■■■ 4.42
RHBDD3-203ENST00000413137 PRXQ9BXM0 1461 aa42.66■■■■■ 4.42
RHBDD3-203ENST00000413137 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.64■■■■■ 4.42
RHBDD3-203ENST00000413137 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
RHBDD3-203ENST00000413137 ADAMTS12P58397 1594 aa42.58■■■■■ 4.41
RHBDD3-203ENST00000413137 CUL7Q14999 1698 aa42.58■■■■■ 4.41
RHBDD3-203ENST00000413137 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.58■■■■■ 4.41
RHBDD3-203ENST00000413137 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.52■■■■■ 4.4
RHBDD3-203ENST00000413137 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.52■■■■■ 4.4
RHBDD3-203ENST00000413137 KIF21BO75037 1637 aa42.49■■■■■ 4.39
RHBDD3-203ENST00000413137 SYNJ2O15056 1496 aa42.46■■■■■ 4.39
RHBDD3-203ENST00000413137 FBLN2P98095 1184 aa42.45■■■■■ 4.39
RHBDD3-203ENST00000413137 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
RHBDD3-203ENST00000413137 GOLGA3Q08378 1498 aa42.36■■■■■ 4.37
RHBDD3-203ENST00000413137 GRIN2AQ12879 1464 aa42.34■■■■■ 4.37
RHBDD3-203ENST00000413137 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
RHBDD3-203ENST00000413137 CHD1O14646 1710 aa42.26■■■■■ 4.36
RHBDD3-203ENST00000413137 CEP170Q5SW79 1584 aa42.12■■■■■ 4.33
RHBDD3-203ENST00000413137 NUP160Q12769 1436 aa42.1■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms