RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521836.1

TCEA1-209, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-209ENST00000521836 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.07■■■■■ 7.21
TCEA1-209ENST00000521836 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.85■■■■■ 6.21
TCEA1-209ENST00000521836 ABCC9O60706 1549 aa53.52■■■■■ 6.16
TCEA1-209ENST00000521836 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.19■■■■■ 5.78
TCEA1-209ENST00000521836 NACADO15069 1562 aa50.91■■■■■ 5.74
TCEA1-209ENST00000521836 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.67■■■■■ 5.7
TCEA1-209ENST00000521836 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.33■■■■■ 5.65
TCEA1-209ENST00000521836 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.9■■■■■ 5.58
TCEA1-209ENST00000521836 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.87■■■■■ 5.57
TCEA1-209ENST00000521836 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.56
TCEA1-209ENST00000521836 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.8■■■■■ 5.56
TCEA1-209ENST00000521836 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.73■■■■■ 5.55
TCEA1-209ENST00000521836 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.49■■■■■ 5.51
TCEA1-209ENST00000521836 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.14■■■■■ 5.46
TCEA1-209ENST00000521836 SCRIBQ14160 1630 aa48.95■■■■■ 5.43
TCEA1-209ENST00000521836 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.37■■■■■ 5.33
TCEA1-209ENST00000521836 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
TCEA1-209ENST00000521836 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.26■■■■■ 5.32
TCEA1-209ENST00000521836 NCAPD3P42695 1498 aa46.97■■■■■ 5.11
TCEA1-209ENST00000521836 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.8■■■■■ 5.08
TCEA1-209ENST00000521836 SMARCA4P51532 1647 aa46.78■■■■■ 5.08
TCEA1-209ENST00000521836 SMARCA2P51531 1590 aa46.77■■■■■ 5.08
TCEA1-209ENST00000521836 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
TCEA1-209ENST00000521836 HMGXB3Q12766 1538 aa46.63■■■■■ 5.05
TCEA1-209ENST00000521836 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
TCEA1-209ENST00000521836 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.39■■■■■ 5.02
TCEA1-209ENST00000521836 ERCC6Q03468 1493 aa46.32■■■■■ 5.01
TCEA1-209ENST00000521836 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.2■■■■■ 4.99
TCEA1-209ENST00000521836 CUX2O14529 1486 aa46.19■■■■■ 4.98
TCEA1-209ENST00000521836 NESP48681 1621 aa45.97■■■■■ 4.95
TCEA1-209ENST00000521836 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.88■■■■■ 4.94
TCEA1-209ENST00000521836 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.87■■■■■ 4.93
TCEA1-209ENST00000521836 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.69■■■■■ 4.9
TCEA1-209ENST00000521836 WIZO95785 1651 aa45.64■■■■■ 4.9
TCEA1-209ENST00000521836 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.57■■■■■ 4.88
TCEA1-209ENST00000521836 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
TCEA1-209ENST00000521836 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.41■■■■■ 4.86
TCEA1-209ENST00000521836 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
TCEA1-209ENST00000521836 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
TCEA1-209ENST00000521836 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.17■■■■■ 4.82
TCEA1-209ENST00000521836 CFTRP13569 1480 aa45.06■■■■■ 4.8
TCEA1-209ENST00000521836 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.05■■■■■ 4.8
TCEA1-209ENST00000521836 WDR62O43379 1518 aa45.02■■■■■ 4.8
TCEA1-209ENST00000521836 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.99■■■■■ 4.79
TCEA1-209ENST00000521836 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.65■■■■■ 4.74
TCEA1-209ENST00000521836 PRDM2Q13029 1718 aa44.58■■■■■ 4.73
TCEA1-209ENST00000521836 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
TCEA1-209ENST00000521836 ABCC8Q09428 1581 aa44.26■■■■■ 4.68
TCEA1-209ENST00000521836 OSCARQ8IYS5 282 aa44.18■■■■■ 4.66
TCEA1-209ENST00000521836 IFT140Q96RY7 1462 aa44.18■■■■■ 4.66
TCEA1-209ENST00000521836 TOPBP1Q92547 1522 aa44.14■■■■■ 4.66
TCEA1-209ENST00000521836 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.03■■■■■ 4.64
TCEA1-209ENST00000521836 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
TCEA1-209ENST00000521836 TRIM41Q8WV44 630 aa43.89■■■■■ 4.62
TCEA1-209ENST00000521836 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
TCEA1-209ENST00000521836 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
TCEA1-209ENST00000521836 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
TCEA1-209ENST00000521836 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
TCEA1-209ENST00000521836 SOGA1O94964 1423 aa43.58■■■■■ 4.57
TCEA1-209ENST00000521836 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
TCEA1-209ENST00000521836 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.48■■■■■ 4.55
TCEA1-209ENST00000521836 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
TCEA1-209ENST00000521836 WDR97A6NE52 1622 aa43.45■■■■■ 4.55
TCEA1-209ENST00000521836 CUX1P39880 1505 aa43.41■■■■■ 4.54
TCEA1-209ENST00000521836 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
TCEA1-209ENST00000521836 FBLN2P98095 1184 aa43.37■■■■■ 4.53
TCEA1-209ENST00000521836 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
TCEA1-209ENST00000521836 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
TCEA1-209ENST00000521836 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
TCEA1-209ENST00000521836 CHD1O14646 1710 aa43.32■■■■■ 4.53
TCEA1-209ENST00000521836 ARHGEF11O15085 1522 aa43.3■■■■■ 4.52
TCEA1-209ENST00000521836 GRIN2BQ13224 1484 aa43.19■■■■■ 4.5
TCEA1-209ENST00000521836 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
TCEA1-209ENST00000521836 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.18■■■■■ 4.5
TCEA1-209ENST00000521836 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
TCEA1-209ENST00000521836 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.05■■■■■ 4.48
TCEA1-209ENST00000521836 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.03■■■■■ 4.48
TCEA1-209ENST00000521836 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.03■■■■■ 4.48
TCEA1-209ENST00000521836 SYNJ2O15056 1496 aa43■■■■■ 4.47
TCEA1-209ENST00000521836 SYNJ1O43426 1573 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA1-209ENST00000521836 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
TCEA1-209ENST00000521836 PBRM1Q86U86 1689 aa42.92■■■■■ 4.46
TCEA1-209ENST00000521836 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
TCEA1-209ENST00000521836 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.86■■■■■ 4.45
TCEA1-209ENST00000521836 TOP2BQ02880 1626 aa42.85■■■■■ 4.45
TCEA1-209ENST00000521836 ARAP1Q96P48 1450 aa42.84■■■■■ 4.45
TCEA1-209ENST00000521836 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.82■■■■■ 4.45
TCEA1-209ENST00000521836 GRIN2AQ12879 1464 aa42.59■■■■■ 4.41
TCEA1-209ENST00000521836 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.54■■■■■ 4.4
TCEA1-209ENST00000521836 ADAMTS12P58397 1594 aa42.53■■■■■ 4.4
TCEA1-209ENST00000521836 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.53■■■■■ 4.4
TCEA1-209ENST00000521836 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
TCEA1-209ENST00000521836 NUP160Q12769 1436 aa42.44■■■■■ 4.38
TCEA1-209ENST00000521836 CEP170Q5SW79 1584 aa42.32■■■■■ 4.37
TCEA1-209ENST00000521836 SHROOM2Q13796 1616 aa42.18■■■■■ 4.34
TCEA1-209ENST00000521836 KIF27Q86VH2 1401 aa42.13■■■■■ 4.34
TCEA1-209ENST00000521836 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
TCEA1-209ENST00000521836 JPH4Q96JJ6 628 aa42.07■■■■■ 4.33
TCEA1-209ENST00000521836 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
TCEA1-209ENST00000521836 IGF1RP08069 1367 aa42.01■■■■■ 4.31
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