RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488106.1

RHBDD3-205, Transcript of rhomboid domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene RHBDD3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3-205ENST00000488106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.89■■■■■ 6.86
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RHBDD3-205ENST00000488106 ABCC9O60706 1549 aa50.61■■■■■ 5.69
RHBDD3-205ENST00000488106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.64■■■■■ 5.38
RHBDD3-205ENST00000488106 NACADO15069 1562 aa48.5■■■■■ 5.35
RHBDD3-205ENST00000488106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.36■■■■■ 5.33
RHBDD3-205ENST00000488106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
RHBDD3-205ENST00000488106 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.07■■■■■ 5.29
RHBDD3-205ENST00000488106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.85■■■■■ 5.25
RHBDD3-205ENST00000488106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.81■■■■■ 5.24
RHBDD3-205ENST00000488106 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.19■■■■■ 5.14
RHBDD3-205ENST00000488106 SCRIBQ14160 1630 aa47.17■■■■■ 5.14
RHBDD3-205ENST00000488106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
RHBDD3-205ENST00000488106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.57■■■■■ 5.04
RHBDD3-205ENST00000488106 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.42■■■■■ 5.02
RHBDD3-205ENST00000488106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
RHBDD3-205ENST00000488106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.84■■■■■ 4.93
RHBDD3-205ENST00000488106 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.44■■■■■ 4.87
RHBDD3-205ENST00000488106 SMARCA4P51532 1647 aa45.06■■■■■ 4.8
RHBDD3-205ENST00000488106 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
RHBDD3-205ENST00000488106 SMARCA2P51531 1590 aa44.72■■■■■ 4.75
RHBDD3-205ENST00000488106 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.71■■■■■ 4.75
RHBDD3-205ENST00000488106 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.65■■■■■ 4.74
RHBDD3-205ENST00000488106 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
RHBDD3-205ENST00000488106 HMGXB3Q12766 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
RHBDD3-205ENST00000488106 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.54■■■■■ 4.72
RHBDD3-205ENST00000488106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
RHBDD3-205ENST00000488106 WIZO95785 1651 aa44.28■■■■■ 4.68
RHBDD3-205ENST00000488106 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
RHBDD3-205ENST00000488106 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
RHBDD3-205ENST00000488106 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
RHBDD3-205ENST00000488106 ERCC6Q03468 1493 aa43.64■■■■■ 4.58
RHBDD3-205ENST00000488106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.63■■■■■ 4.58
RHBDD3-205ENST00000488106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.44■■■■■ 4.54
RHBDD3-205ENST00000488106 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.33■■■■■ 4.53
RHBDD3-205ENST00000488106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.23■■■■■ 4.51
RHBDD3-205ENST00000488106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
RHBDD3-205ENST00000488106 CUX2O14529 1486 aa43.16■■■■■ 4.5
RHBDD3-205ENST00000488106 PRDM2Q13029 1718 aa43.14■■■■■ 4.5
RHBDD3-205ENST00000488106 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.13■■■■■ 4.49
RHBDD3-205ENST00000488106 CFTRP13569 1480 aa43.09■■■■■ 4.49
RHBDD3-205ENST00000488106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.94■■■■■ 4.46
RHBDD3-205ENST00000488106 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.93■■■■■ 4.46
RHBDD3-205ENST00000488106 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.87■■■■■ 4.45
RHBDD3-205ENST00000488106 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
RHBDD3-205ENST00000488106 WDR62O43379 1518 aa42.77■■■■■ 4.44
RHBDD3-205ENST00000488106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
RHBDD3-205ENST00000488106 TOPBP1Q92547 1522 aa42.26■■■■■ 4.36
RHBDD3-205ENST00000488106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.24■■■■■ 4.35
RHBDD3-205ENST00000488106 ABCC8Q09428 1581 aa42.17■■■■■ 4.34
RHBDD3-205ENST00000488106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.11■■■■■ 4.33
RHBDD3-205ENST00000488106 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
RHBDD3-205ENST00000488106 CUX1P39880 1505 aa41.91■■■■■ 4.3
RHBDD3-205ENST00000488106 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
RHBDD3-205ENST00000488106 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
RHBDD3-205ENST00000488106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
RHBDD3-205ENST00000488106 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
RHBDD3-205ENST00000488106 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
RHBDD3-205ENST00000488106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.7■■■■■ 4.27
RHBDD3-205ENST00000488106 SOGA1O94964 1423 aa41.63■■■■■ 4.26
RHBDD3-205ENST00000488106 WDR97A6NE52 1622 aa41.61■■■■■ 4.25
RHBDD3-205ENST00000488106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.61■■■■■ 4.25
RHBDD3-205ENST00000488106 SYNJ1O43426 1573 aa41.56■■■■■ 4.24
RHBDD3-205ENST00000488106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.241e-7■■■■■ 37.9
RHBDD3-205ENST00000488106 TOP2BQ02880 1626 aa41.55■■■■■ 4.24
RHBDD3-205ENST00000488106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
RHBDD3-205ENST00000488106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
RHBDD3-205ENST00000488106 CHD1O14646 1710 aa41.41■■■■■ 4.22
RHBDD3-205ENST00000488106 PBRM1Q86U86 1689 aa41.39■■■■■ 4.22
RHBDD3-205ENST00000488106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.32■■■■■ 4.2
RHBDD3-205ENST00000488106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.3■■■■■ 4.2
RHBDD3-205ENST00000488106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.23■■■■■ 4.19
RHBDD3-205ENST00000488106 OSCARQ8IYS5 282 aa41.23■■■■■ 4.19
RHBDD3-205ENST00000488106 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.21■■■■■ 4.19
RHBDD3-205ENST00000488106 GRIN2BQ13224 1484 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDD3-205ENST00000488106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
RHBDD3-205ENST00000488106 FBLN2P98095 1184 aa41.07■■■■■ 4.17
RHBDD3-205ENST00000488106 SYNJ2O15056 1496 aa40.96■■■■■ 4.15
RHBDD3-205ENST00000488106 ADAMTS12P58397 1594 aa40.92■■■■■ 4.14
RHBDD3-205ENST00000488106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
RHBDD3-205ENST00000488106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
RHBDD3-205ENST00000488106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
RHBDD3-205ENST00000488106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
RHBDD3-205ENST00000488106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.85■■■■■ 4.13
RHBDD3-205ENST00000488106 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
RHBDD3-205ENST00000488106 ARHGEF11O15085 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
RHBDD3-205ENST00000488106 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
RHBDD3-205ENST00000488106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.68■■■■■ 4.1
RHBDD3-205ENST00000488106 TRIM41Q8WV44 630 aa40.66■■■■■ 4.1
RHBDD3-205ENST00000488106 KIF27Q86VH2 1401 aa40.64■■■■■ 4.1
RHBDD3-205ENST00000488106 CEP170Q5SW79 1584 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDD3-205ENST00000488106 CUL7Q14999 1698 aa40.57■■■■■ 4.09
RHBDD3-205ENST00000488106 NUP160Q12769 1436 aa40.48■■■■■ 4.07
RHBDD3-205ENST00000488106 IGF1RP08069 1367 aa40.42■■■■■ 4.06
RHBDD3-205ENST00000488106 ARAP1Q96P48 1450 aa40.39■■■■■ 4.06
RHBDD3-205ENST00000488106 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.33■■■■■ 4.05
RHBDD3-205ENST00000488106 SHROOM2Q13796 1616 aa40.32■■■■■ 4.05
RHBDD3-205ENST00000488106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.25■■■■■ 4.03
RHBDD3-205ENST00000488106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.24■■■■■ 4.03
RHBDD3-205ENST00000488106 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.22■■■■■ 4.03
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