Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BPIFB4P59827 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BPIFB4P59827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BPIFB4P59827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFB4P59827 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFB4P59827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFB4P59827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms