Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2BFSP57053 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2BFSP57053 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2BFSP57053 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2BFSP57053 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2BFSP57053 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms