Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPTEP56180 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPTEP56180 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPTEP56180 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPTEP56180 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPTEP56180 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPTEP56180 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPTEP56180 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPTEP56180 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPTEP56180 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPTEP56180 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPTEP56180 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPTEP56180 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPTEP56180 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPTEP56180 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPTEP56180 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPTEP56180 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPTEP56180 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPTEP56180 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPTEP56180 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPTEP56180 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPTEP56180 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPTEP56180 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPTEP56180 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPTEP56180 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPTEP56180 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPTEP56180 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPTEP56180 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPTEP56180 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPTEP56180 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPTEP56180 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPTEP56180 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPTEP56180 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPTEP56180 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPTEP56180 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPTEP56180 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPTEP56180 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPTEP56180 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPTEP56180 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTEP56180 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTEP56180 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTEP56180 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTEP56180 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTEP56180 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTEP56180 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTEP56180 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTEP56180 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTEP56180 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTEP56180 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTEP56180 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTEP56180 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTEP56180 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTEP56180 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTEP56180 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTEP56180 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTEP56180 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTEP56180 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPTEP56180 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPTEP56180 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPTEP56180 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPTEP56180 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPTEP56180 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPTEP56180 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPTEP56180 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPTEP56180 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPTEP56180 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPTEP56180 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPTEP56180 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPTEP56180 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPTEP56180 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPTEP56180 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPTEP56180 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPTEP56180 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPTEP56180 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPTEP56180 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPTEP56180 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPTEP56180 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPTEP56180 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPTEP56180 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPTEP56180 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPTEP56180 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPTEP56180 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPTEP56180 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPTEP56180 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPTEP56180 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPTEP56180 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPTEP56180 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPTEP56180 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPTEP56180 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPTEP56180 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPTEP56180 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPTEP56180 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms