Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AQP4P55087 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AQP4P55087 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AQP4P55087 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AQP4P55087 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AQP4P55087 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AQP4P55087 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AQP4P55087 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AQP4P55087 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AQP4P55087 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AQP4P55087 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AQP4P55087 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AQP4P55087 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AQP4P55087 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AQP4P55087 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AQP4P55087 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AQP4P55087 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AQP4P55087 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AQP4P55087 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AQP4P55087 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AQP4P55087 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AQP4P55087 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AQP4P55087 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AQP4P55087 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AQP4P55087 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AQP4P55087 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AQP4P55087 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AQP4P55087 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AQP4P55087 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AQP4P55087 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AQP4P55087 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AQP4P55087 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AQP4P55087 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AQP4P55087 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AQP4P55087 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AQP4P55087 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AQP4P55087 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AQP4P55087 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AQP4P55087 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AQP4P55087 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AQP4P55087 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AQP4P55087 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AQP4P55087 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AQP4P55087 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AQP4P55087 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AQP4P55087 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AQP4P55087 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AQP4P55087 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AQP4P55087 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AQP4P55087 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AQP4P55087 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AQP4P55087 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AQP4P55087 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AQP4P55087 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AQP4P55087 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AQP4P55087 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AQP4P55087 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AQP4P55087 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AQP4P55087 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AQP4P55087 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AQP4P55087 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AQP4P55087 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AQP4P55087 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AQP4P55087 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AQP4P55087 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AQP4P55087 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AQP4P55087 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AQP4P55087 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AQP4P55087 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AQP4P55087 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AQP4P55087 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AQP4P55087 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AQP4P55087 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AQP4P55087 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AQP4P55087 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AQP4P55087 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AQP4P55087 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AQP4P55087 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AQP4P55087 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AQP4P55087 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AQP4P55087 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AQP4P55087 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AQP4P55087 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AQP4P55087 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AQP4P55087 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AQP4P55087 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AQP4P55087 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AQP4P55087 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AQP4P55087 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AQP4P55087 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AQP4P55087 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AQP4P55087 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AQP4P55087 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AQP4P55087 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AQP4P55087 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms