Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HK3P52790 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HK3P52790 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HK3P52790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HK3P52790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HK3P52790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HK3P52790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HK3P52790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HK3P52790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HK3P52790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HK3P52790 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HK3P52790 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HK3P52790 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HK3P52790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HK3P52790 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HK3P52790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HK3P52790 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HK3P52790 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HK3P52790 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HK3P52790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HK3P52790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HK3P52790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HK3P52790 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HK3P52790 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HK3P52790 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HK3P52790 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HK3P52790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HK3P52790 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HK3P52790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HK3P52790 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HK3P52790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HK3P52790 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HK3P52790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HK3P52790 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HK3P52790 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HK3P52790 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HK3P52790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HK3P52790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HK3P52790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HK3P52790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HK3P52790 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HK3P52790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HK3P52790 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HK3P52790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HK3P52790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HK3P52790 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HK3P52790 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HK3P52790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HK3P52790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HK3P52790 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HK3P52790 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HK3P52790 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HK3P52790 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HK3P52790 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HK3P52790 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HK3P52790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HK3P52790 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HK3P52790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HK3P52790 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HK3P52790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HK3P52790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HK3P52790 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HK3P52790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HK3P52790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HK3P52790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HK3P52790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HK3P52790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HK3P52790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HK3P52790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HK3P52790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HK3P52790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HK3P52790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HK3P52790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HK3P52790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HK3P52790 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HK3P52790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HK3P52790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HK3P52790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HK3P52790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HK3P52790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HK3P52790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HK3P52790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HK3P52790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HK3P52790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HK3P52790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms