Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8P50990 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8P50990 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8P50990 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8P50990 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8P50990 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCT8P50990 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCT8P50990 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8P50990 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8P50990 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8P50990 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8P50990 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8P50990 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8P50990 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8P50990 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8P50990 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8P50990 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8P50990 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8P50990 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8P50990 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8P50990 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8P50990 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8P50990 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8P50990 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8P50990 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCT8P50990 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCT8P50990 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCT8P50990 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8P50990 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8P50990 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8P50990 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8P50990 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8P50990 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCT8P50990 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCT8P50990 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8P50990 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8P50990 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8P50990 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCT8P50990 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCT8P50990 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCT8P50990 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8P50990 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8P50990 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8P50990 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8P50990 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8P50990 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8P50990 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8P50990 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8P50990 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8P50990 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8P50990 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8P50990 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8P50990 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8P50990 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8P50990 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCT8P50990 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8P50990 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8P50990 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8P50990 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8P50990 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCT8P50990 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8P50990 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8P50990 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8P50990 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8P50990 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCT8P50990 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCT8P50990 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCT8P50990 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCT8P50990 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8P50990 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8P50990 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8P50990 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8P50990 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8P50990 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8P50990 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8P50990 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8P50990 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8P50990 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8P50990 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8P50990 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8P50990 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8P50990 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8P50990 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8P50990 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCT8P50990 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCT8P50990 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCT8P50990 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8P50990 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8P50990 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8P50990 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8P50990 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8P50990 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8P50990 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8P50990 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8P50990 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8P50990 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8P50990 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8P50990 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8P50990 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8P50990 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms