Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINF1P36955 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINF1P36955 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINF1P36955 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINF1P36955 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINF1P36955 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms