Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGS1P23219 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGS1P23219 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGS1P23219 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTGS1P23219 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTGS1P23219 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTGS1P23219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms