Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZSCAN20P17040 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZSCAN20P17040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSCAN20P17040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZSCAN20P17040 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZSCAN20P17040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZSCAN20P17040 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSCAN20P17040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms