Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GP1BBP13224 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GP1BBP13224 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GP1BBP13224 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GP1BBP13224 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GP1BBP13224 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GP1BBP13224 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GP1BBP13224 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms