Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEPDP12955 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEPDP12955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEPDP12955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEPDP12955 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEPDP12955 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEPDP12955 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEPDP12955 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEPDP12955 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEPDP12955 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEPDP12955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEPDP12955 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PEPDP12955 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEPDP12955 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEPDP12955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEPDP12955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEPDP12955 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEPDP12955 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEPDP12955 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEPDP12955 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEPDP12955 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PEPDP12955 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEPDP12955 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEPDP12955 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEPDP12955 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEPDP12955 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEPDP12955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEPDP12955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEPDP12955 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEPDP12955 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEPDP12955 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PEPDP12955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEPDP12955 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEPDP12955 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEPDP12955 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEPDP12955 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEPDP12955 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEPDP12955 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEPDP12955 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEPDP12955 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEPDP12955 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEPDP12955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEPDP12955 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PEPDP12955 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEPDP12955 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEPDP12955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEPDP12955 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEPDP12955 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PEPDP12955 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEPDP12955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEPDP12955 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEPDP12955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEPDP12955 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEPDP12955 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEPDP12955 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEPDP12955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEPDP12955 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEPDP12955 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEPDP12955 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEPDP12955 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEPDP12955 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEPDP12955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEPDP12955 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEPDP12955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEPDP12955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEPDP12955 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms