Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC1P07992 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC1P07992 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC1P07992 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC1P07992 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC1P07992 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms