Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRYBA1P05813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRYBA1P05813 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRYBA1P05813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRYBA1P05813 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRYBA1P05813 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRYBA1P05813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms