Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED1O96006 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED1O96006 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED1O96006 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED1O96006 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED1O96006 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED1O96006 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED1O96006 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms