Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPNE6O95741 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPNE6O95741 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPNE6O95741 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPNE6O95741 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE6O95741 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE6O95741 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms